Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms