Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ssbp4Q3U4B1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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