Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc39dQ0VF76 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms