Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc2Q05020 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Apoc2Q05020 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms