Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Thbs2Q03350 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms