Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms