Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Otx2P80206 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms