Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tbx6P70327 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms