Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ufm1P61961 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ufm1P61961 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms