Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PmchP56942 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PmchP56942 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PmchP56942 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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