Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sh3bp1P55194 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms