Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TspoP50637 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TspoP50637 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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