Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprkP35822 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprkP35822 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprkP35822 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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