Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TpoP35419 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TpoP35419 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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TpoP35419 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TpoP35419 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms