Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gjb1P28230 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gjb1P28230 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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