Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Xrcc5P27641 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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