Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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NdnP25233 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NdnP25233 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NdnP25233 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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