Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Hoxd8P23463 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Hoxd8P23463 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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