Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PparaP23204 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PparaP23204 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PparaP23204 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PparaP23204 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PparaP23204 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms