Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P18532 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P18532 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
P18532 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
P18532 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms