Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ifnb1P01575 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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