Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Ccl20O89093 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ccl20O89093 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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