Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cfdp1O88271 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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