Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Vmn1r58G3X9U3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms