Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8005F6YKY3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms