Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3250E9Q1M3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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