Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AU015836B2RUM3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AU015836B2RUM3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms