Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtf1A2AQ19 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms