Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lcn6A2AJB9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms