Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ckap5A2AGT5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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