Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn6Q9Z262 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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