Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sfrp4Q9Z1N6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms