Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek4Q9Z1J2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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