Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sema6cQ9WTM3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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