Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam50bQ9WTJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam50bQ9WTJ8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms