Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Crlf1Q9JM58 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Crlf1Q9JM58 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms