Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cabp1Q9JLK7 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms