Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ybx3Q9JKB3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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