Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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DysfQ9ESD7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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