Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms