Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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