Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Swt1Q9DBQ9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms