Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf138rt1Q9D9M9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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