Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Snx5Q9D8U8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms