Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmed11Q9D2R4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Tmed11Q9D2R4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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