Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Mrpl28Q9D1B9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Mrpl28Q9D1B9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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