Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnot11Q9CWN7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Cnot11Q9CWN7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cnot11Q9CWN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Cnot11Q9CWN7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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