Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms