Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PompQ9CQT5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PompQ9CQT5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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PompQ9CQT5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PompQ9CQT5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms