Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NsmfQ99NF2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms